Есть форма в которой есть <textarea>
Для проверки валидности я должен передать эту форму на PHP-скрипт, для очистки от "мусора" и вернуть обратно, но с сохранением переносов строки. 

Как это лучше сделать?

если имеются ввиду просто переносы, а не нажатия клавишы enter, то не получится, ибо перенос - это исключительно зрительная фишка, в тексте не обладающая никакой структурой.
единственное, можно вроде textarea задать обозначать переносы как \n, в таком случае он встанет обратно, как и был. но имхо, это ересь ещё та

не так выразился, переносы по Ентер 

ну так не вырезай эти переносы на сервере и всё. текст останется в норме

передавать то как 
$("#text").val()
или 
$("#text").html()

значение поля - это value, а не DOM-содержимое

в общем, я передаю на сервер это

на сервере обрабатываю данные, т.е. удаляю лишние пробелы, тэги, определённый код и возвращаю обратно. При этом мне нужно чтобы в <textarea> вернулись и "Enter`ы".

Я просто не могу понять, вообще передаётся ли \n и \r? пытаюсь применить nl2br(), но что-то ничего нет. Данные возвращаются в одну строчку.. Вот к примеру скрипт на сервере

?
  

Amphiluke, спасибо, всё заработало   
тема закрыта!