Я бы рекомендовал не зацикливаться на PHP, а взять тему, возможно менее знакомую вам (тут есть и плюс - разберетесь), но зато более понятную комиссии и соответствующую учебному плану. Когда я выбирал оную тему, я так же сперва хотел написать о том, о чем знаю или о том, с чем работаю. Хотел написать про PHP фреймворки, но после фразы одного из членов ГАК "а что тут писать, тут всем ясно что Joomla лучший фрейморк" я сделал фейспалм и понял, что лучше брать тему, в которой комиссия более осведомлена. Я открыл учебный план (точно не помню как называется, на сайте университета нашел, эта штука больше для абитуриентов, показывает мол что студент вообще за 4-5-6 лет обучения в итоге будет уметь делать) и от туда среди тезисов выделил основные идеи, которыми меня должен был научить по идеи университет и на их основе выбрал для себя в общем-то далеко не близкую мне тему "Виртуальная ИТ инфраструктура на предприятиях малого бизнеса". Если что, университет http://www.ifmo.ru.