Потому что, когда ты подключаешь класс и создаёшь объект этого класса, ты ничего не грузишь, все методы подгружаются по мере их нужды, т.е. вызовов. Да и код получается более элегантный, плюс не будет конфликта, если у тебя, в текущем пространстве имён текущего пакета, есть функции с такими же именами, как и в подключаемом модуле.
У модуля немного другая стратегия, он как правило всегда экспортирует свои функции в текущий пакет main. Производительность при использовании модуля выше, потому как он делает экспорт на стадии компиляции.
Потому когда подключаешь какой-нить модуль, всегда нужно стараться использовать его на полную катушку, да бы оправдать его самого.
Вот например:
часто встречаю код, где люди подключают, не маленький, модуль CGI.pm, при этом в подключении используют экспорт стандартных функций use CGI qw( :standard ), что ещё хуже вижу такое подключение use CGI qw( :all );, а пользуются только функией param()
Что не есть гуд. Ну если тебе нужно юзать только param(), то и экспортируй её use CGI qw( :param );, а не все стандартные функции. В данном случае будет экспотированы не все стандартные функции, а только одна param(), соответственно и скорость повысится.