nornad, боюсь, что ничего лучше не придумаю. 

С двойными пробелами, табуляторами и символами типа   побороться можно руками (делая замену на соответствующие символы преред поиском), но это головная боль с составлением коллекции ссылок замены. Фактически, программе нужно скормить полную таблицу юникода, да еще кучу других таблиц. А может стОит поискать уже сделанную библиотеку такого рода замен?

А вот еще идея. Со вторым JTextPane:

• Взять HTML код и заменить в нем все "<" и ">" на какие-нибудь нейтральные символы.
• Поместить полученную ерунду в JTextPane.
• JTextPane должен преобразовать все символы типа &nbsp; в пробелы и т.п.
• Извлечь из JTextPane содержимое как текст без тэгов. Он, видимо, будет и без &nbsp;-ов
• Восстановить "<" и ">" 
• Обработать примерно так, как я писал, но взяв позиции из основного JTextPane, а проходить через HTML код дополнительного.

Не знаю - это просто идея. Может и глупая.

Сомневаюсь, что это действительно спасёт. Как я уже говорил, там проблемы не только с заменой. Есть ещё лидирующие пробелы, которые чаще всего надо удалять, но иногда (например, в теге PRE, если не ошибаюсь) - не надо. То бишь в итоге это сведётся к почти полноценному парсингу хтмла, чего лично я не хотел бы реализовывать.


В любом случае спасибо. Отрицательный результат - тоже результат. Теперь я хотя бы точнее представляю проблемы поиска соответствия тексту в хтмл-коде.
Буду дальше копать код, который нарисовали ребята и ежели разберусь, выложу тут решение. Или хотя бы опишу принцип (если решение окажется слишком громоздким).

nornad, передо мной стоит анлогичная задача, нужно получить html-код выделенного фрагмента, так вот хотелось бы узнать было ли найдено решение. Заранее благодарен.

у всех текстовых компонентов есть метод javax.swing.text.JTextComponent.copy(), он помещает выделенный кусок текста в системный буфер в нескольких форматах. 

если в JEditorPane загрузить хтмл, выделить какой-то кусок, вызвать метод copy, затем перейти в ворд и выбрать из меню Правка/Специальная вставка то он предложит на выбор формат плоского текста или хтмл и всё корректно вставит со ссылками. Т.е. это уже реализовано и прекрасно работает.

У JEditorPane за контент в хтмл вероятно отвечает HTMLEditorKit (т.е. то что в javax.swing.JEditorPane.getEditorKit()), можно в нём посмотреть реализацию или тупо через клипбоард.