Есть необходимость  в разработке визуального генератора заданий. Т.е. будет набор визуальных объектов на форме и набор связей между ними. 
Необходимо предоставить возможность пользователю, посредством перемещения заданных объектов и связывания их, построить рабочий процесс на основе которого сгенерится XML. Который можно будет обратно загружать в форму и редактировать с помошью все тех же визуальных объектов. 

Т.е. по сути реализовать собственный workflow.
Платформа разработки Framework 2.0.
Подскажите пожалуйста в какую сторону двигаться, может есть готовые контролы для этих целей.

Для этого существует готовый инструмент System.Workflow.ComponentModel.Design.WorkflowView. Правда, как ты понимаешь реализован он в .Net Framework 3.0.
Для Framework 2.0. можно поробовать использовать System.ComponentModel.Design.DesignSurface. Он используется для дизайнера форм, но при желании можно приспособить под свои нужды. Одна проблема - задокументирован он из рук вон плохо, поэтому: разберёшься сам - будет тебе счастье, нет - прийдётся сочинять своё.