Собственно заметил что если в TSynEdit включён WordWrap и размеры компонента более ~2070 пикселей, то начинаются всякие фокусы, включая перезапись памяти.
Проблема (кажется) решилась редактированием файла SynEditWordWrap.pas. А именно заменой строчки
  TRowLength = byte;
на
  TRowLength = integer;