если у меня есть файл stuff.js и я хочу из него обратиться к методам файл extra.js , могу ли я как-то к нему подключиться, не использую *.htm файл?

а что делает у тебя такого stuff.js без *.htm? в смысле где работает

stuff.js вызывается *.htm файла. Все это в рамках веб проекта. Но делать вызов из  *.htm файла к обоим js файлам не получится, потому что extra.js оказывается во вне зоны видимости методов файла stuff.js 

точна? или ты говоришь о двух классах?

потому как функции в разных файлах взаимовидны

аналог include

Ну, честно говоря, то что я задумал - почти полное извращенство. 
Я пишу под extJS.
Если extJS создавать серьезный интерфейс, то получается так, что львиной количество кода должно быть заключено в качестве метода для основного события ext.ready({});
Т.е. это аналогично классу. Мне мне захотелось часть кода убрать в другой файл. Так у меня получился extra.js. Теперь мне хотелось бы каким-то образом подключить extra.js в середине stuff.js так, чтобы методы extra.js оказались методами класса события ext.ready({});

Возможно ли такое?