Вообще приложение планируется локальное и мне хотелось сделать минимум сложностей с установкой и администрированием.
В результате размер базы вырос до 1.5 Гб и еще может подрасти раза в 2. H2 милионные таблицы, судя по всему, не тянет.

С MySQL я знаком как пользователь, в принципе можно было бы использовать ее..но оракл попробовать хочется.

Впрочем, мне кажется все это уже не подпадает под тему топика

Я только не понял про "не абстрагировать прикладной уровень от данных".

Честно говоря я планировал просто ConnectionString в программе поменять, а сформированный код и запросы не менять