У меня есть редактор таблицы, в котором можно перемещаться по ячейкам с помощью стрелок. Проблема в том, что при перемещении вверх-вниз страница скроллится в тех же направлениях, а это нужно только при определенных условиях. 

Вопрос такой, можно ли как-нибудь средствами JS отключить скроллинг страницы по стрелкам вверх-вниз, но чтобы сама полоса прокрутки осталась.

ставь отлов события mousedown  c таким обработчиком

А при чем тут отлов событий мышки, если я перемещаюсь по ячейкам таблицы при помощи стрелок клавиатуры?

да, тут не то написал, но сама суть остается той же,  отлавливай нажатие кнопки