Для разработки следующего приложения рассматриваем возможность построения архитектуры с гибким workflow.
Как простейщий пример: при сабмите документа, отправлять почтой сообщение пользователю или нет.
Более сложный пример - при сабмите документа требуется дернуть сервис другой независимой системы.
Т.е. очень желательно иметь возможность делать такие изменения без переписывания кода.
Полностью идеальный вариант: разработчики реализуют api системы. А аналитики рисуют процессы в специализированных тулах.

Как варианты, рассматриваем:
1) http://java-source.net/open-source/workflow-engines/ - отличный ресурс, но присуствует достаточное количество устаревших, уже не поддерживаемыхбиблиотек.

2) Конкретно BPEL стандарт, Apache ODE как пример реализации - как показалось скорее подходит для вызова вебсервисов. А интересует скорее внутренний workflow engine.

3) SCA на примере Apache Tuscany. Имеется ввиду, написание различных вариантов компонент или работа через тот-же BPEL.

Однако в связи с отсутствием опыта в этом направлении однозначного выбора до конца принять не можем.
Может кто нибудь поделиться опытом в этой области? Сможет рассказать о минусах - сильно ли падает производительность и т.п.

Смотри в сторону ActiveVOS  или jboss drools .