нужно в проект, предназначенный для использования на windows 2000, использовать библиотеку из 3го Fraemwork, а именно System.Servicemodel. Я как то читал где то что вроде бы как бы можно бы собрать свой урезанный framework но не могу найти сейчас об этом инфы. Может кто-то делал что-то такое и подскажет?

На маздае должен быть SP4.
.NET Framework 2.0 так же пропатченный.
Надо создать каталог C:\Program Files\Reference Assemblies\Microsoft\Framework\v3.5 и туда скопировать библы.
При особом желании - можно попробывать зарегистрировать их в GAC.
Молиться.

как вариант попробывать исползовать виртулизатор типа Xen Virual App или VMWare ThinApp