Проблема в том, что у меня есть ListView, который содержит множество checkbox. Если пользователь кликает на самом маркере, то срабатывает Checked\Unchecked, а SelectionChanged в ListView не срабатывает. А мне надо, что сначала получить ссылку на выбранную строку, а затем обработать Checked\Uncheked. Что делать?

Пришла в голову только одна идея. Сделать checkbox-ам IsEnabled = false, чтобы пользователь не мог на них щёлкать и переопределить шаблон, чтобы строка не становилась серой. Но это через жопу.

Если ваше решение будет работать то это то что вам надо 

Непонятен ваш сценарий, зачем сначала вам SelectionChanged?

То ли вы хотите синхронизировать выбранные чекбоксы с выбранными элементами в ListView.
Или же просто хотите получить SelectionChanged что бы узнать какая строка с чек боксом отмечена.

Короче мой ListView привязан к списку классов Station. Мне надо предоставить множественный выбор. Я думаю, что сделаю мультивыбор и выкину чекбоксы в топку 

Так в чем проблема собственно? Включите мультиселект SelectionMode="Multiselect" у ListBox

Далее синхронизируйте чекбоксы со списком выбора ListBox.
OnChecked => ListBox.SelectedItems.Add() (или же ListViewItem.IsSelected = true)