Как, с точки зрения производительности лучше поступить? есть таблицы:
MANUFACTURER - данные по производителям
1. id  (autoinc)
2. country (index)
...

ITEMS -  данные по произведенным деталям
1. id (autoinc)
2. manufacturer_id (index)
...

ITEM_OPTIONS - детальные данные  каждой детали
1. id (autoinc)
2. item_id (index) 
3. option_type (index)
4. option_value

собственно суть их, думаю ясна. 
в функционале системы постоянные выборки, вида: 


Учитывая то что записей в ITEMS будет большое кол-во (около миллиона) встает вопрос:
Имеет смысл под каждый вид ITEMS создавать свою таблицу, в которой будут храниться все данные (сейчас для специфических детальных данных используется отдельная таблица ITEM_OPTIONS)  тогда выборка будет проходить без использования JOIN и других таблиц.. насколько это ускорит работу? 
И насколько замедлится работа, если мне нужно будет получить данные по всем таблицами, учитывая например только поле country?

нет.


Это немного.