Нужно из скрипта запустить другую программу, при этом если она не завершится через определенное время, то убить ее, или покрайней мере продолжить выполнение скрипта, как это лучше организовать.

почитай про system fork может чем поможет, не поможет обращайся

Мне нужно выполнить следующее:

Код

[запускаю команду] if [команда вернула OK] {   [действие1]; } else {   [действие2]; };

При этом может выполняться несколько команд подрят или параллельно (не важно).

Если команда выполняет бесконечный цикл, то скрипт соответсвтенно вешается.
По хорошему конечно нужно использовать fork для каждой команды, но в условии используются SQL запросы к базе, а как я понял DBI "не дружит" с многопоточностью, можно конечно организовать pipe, но не надо мне этого всего, зачем усложнять программу, так как нормальное время выполнения команды <5 сек, а если больше, то это можно приравнять к ошибке.
Нет ли какой-нибудь команды типа runcmd([команда],[тайм аут])?