Кроме основного окна, в программе имеется ещё одно. Основанное на диалоге. Создаётся оно с начала работы программы, но показывается время от времени.
Задача такая:
В то время когда окошко видно, оно должно:
_Скрываться когда главное окно сворачиваеться
_Появляться когда Главное окно восстанавливается
_Появляться (но не активизироваться (типа SW_SHOWNA)) когда Главное окно активизируется
_Исчезать когда Главное окно теряет фокус

Короче быть как-бы модальным окном.
Но в тоже время оба окна должны иметь возможность получить фокус.

Да и самое главное: дополнительное окно должно быть всё время поверх главного окна.

Как бы это сделать попроще.

Устал уже ловить сообщения одного окна из другого.
Только начал писать программу, а она уже забита кучей функций.

Чуствую что можно сделать проще. То что я хочу встречаться очень часто.
Может настроить определённым образом свойства окна/окон?

Самое простое (в MFC) - использовать не диалог, а диалоговую панель (CDialogBar), со стилем CBRS_MULTIU и запретить ей пристыковку. Если не ошибаюсь, получишь все, что перечислил. Почитай про docking control bars в MFC, чтобы разобраться с возможными стилями.

Наверное такая панель подошла бы, но есть одна проблема - у меня главное окно на основе CDialog.

Да, главное окно должно быть СFrameWnd. Так в чем проблема? Сделай CFrameWnd + СFormView вместо диалога. Иначе придется все нужное поведение панели руками писать. CFrame Wnd, кроме прочего, много полезного умеет, что не умеет диалог - подсказки показывать, команды диспетчить по разному, OnIdleUpdate и пр.пр.пр.

OK. Попытаемся изучить.