Есть функция, по ней строится график, выводится на экран, хочу, чтобы при движении курсора мыши вдоль графика, выводились его координаты (x,y) в отдельном окне. Можно это реализовать с помощью PHP и ее библиотек?

Это реализуется с помощью JavaScript.
На графике по onMouseMove пишешь координаты курсора туда, куда тебе нужно.
Добавлено @ 10:06
В догонку: http://www.walterzorn.de/grapher/grapher.htm

спасибо, значит выход один – с помощью JavaScript привязывать курсор мыши к “картинке” графика функции и выводить координаты экрана относительно этой картинки…?

Угу