1. При закрытии Database Desktop всегда вываливается сообщение об ошибке: Unexpected: General Protection Violation.
2. Как можно быстро открыть большие dbf таблицы (20-30Мb)? Обычно этот процесс занимает до 10 секунд. Знаю, что существует более быстрый способ, но так и не смог его найти

1) Переустановить BDE
2) - Не использовать TTable, TADOTable для работы с таблицей - все делать через TQuery, TADOQuery и никогда не кверить всю таблицу (т.е. не писать "select * from myTable") - кверить только те данные которые нужны, во всех квери ставить жесткие условия выбора записей.
 - Создать нужные индексы
 - Для таблиц такого размера целесообразен переход на какой-нибудь сервер баз данных, например MS SQL Server

1. Всё свеже установленное. Может быть существуют настройки в BDE?
2. А как же в DatabaseDesktop'е моментально открываются те же самые таблицы?

1) Никакие настройки не помогут. Где-то серьезный конфликт
2) Десктоп открывает не всю таблицу, а "выкверяет" данные по мере надобности, т.е. то что ты в данный момент видишь на экране. Для этого можно использовать либо query либо асинхронный доступ - т.е. когда данные появляются сразу, а не ждется до их полного получения, но программировать ассинхронный доступ достаточно сложная работа, надо все время проверять текущий статус операции и следить чтобы вновь приходящие события не конфликтовали с текущими процессами.