Очень странное мигание на экране - похоже на то, что некоторые окна перерисовывают свое содержимое. Это началось сразу после установки рантайма GTK 2.0. Наблюдается это время от времени, переустановка драйвером видеокарты не помогло. В чем может быть причина? Неужто проблемы с железом, или это косяк в системе? 

А ты не пробывал её удалить? 

st1ng3r, удалил, не помогло. 

Амортизатор,  опиши подробней, что происходит. 

Время от времени (с периодом 4-5 минут) экран мелькал - этакое быстрое мельтешение, которое обычно наблюдается при многократных обновлениях окон. Сначала я подумал, что проблемы с оборудованием, но с клоном системы на winware все было нормально. Потом я заметил, что частота мигания зависит от того, что за окно, и от того, сколько времени требуется на его обновление. Окна, на прорисовку которых уходит больше времени, мелькали реже, свинговые окна (Java-swing) так вообще мелькали медленнее всего. Из чего я сделал вывод, что это косяк с GDI,  то ли там окнам не в тему посылалось сообщение на перерисовку, то ли еще что. Откатился с бекапа, все стало нормально, однако причина до сих пор не понятна. Думаю, что это было, скорее всего, из-за GTK. Может, у кого-нибудь были похожие проблемы? 

а не пытался воостановить контрольную точку (восстановление системы) 

Akella,