Итак, в корне у нас есть куча классов, один из них - Graph. Он типа singleton.

Ну и есть подкаталог Controls. Там к примеру есть класс HSms.
У всех классов там package Controls;

Как теперь из объекта HSms получить ссылку на объект Graph?

Если писать

то компилер ругается('.' expected на строку import Graph;), хотя IDEA все правильно парсит и говорит, что нет ошибки....

Как поступить?

Назначь пакет классу Graph, напр.

а потом так:

 т.е. придется их еще в каталог пихать под названием этого пекеджа?

нет, не обязательно.

Добавлено @ 14:12 
Если ты собираешь с помощью IDEA - 
Settings->Modules->Paths
У меня обычно все сорсы лежат в папке src.
Помечаешь эту папку как Sources(правой кнопкой мыши и там найдешь)
Она появится в левом окне.
Кликаешь там на кнопочку(она подсвечивается как set package prefix)
Ну, а там какой package хошь, такой и пиши 
НО, желательно чтоб пакеты соответствовали папкам

 нет =\

С помощью WTK2 )

В этой ситуации какой выход?

выход найден: загнал в package =\