Ну что вы все не поймете? Я который день говорю, что это не может быть дед-лок.
не 2 суток бесперестанной работы, а просто 2 суток, 1 день полностью беседовали, вырубил комп, второй день серв в холостую проработал. Третий день, полдня поработал, кто-то ко мне приконнектился, и все, комп умер.

при 3,5 тысячах потоках объем памяти сервера не превысил 30 мБ, и комп чувствовал себя бодренько, так что зря вы так.

С синхронизацией я тоже разобрался, было время что не работало, но неработало, в плане того что в поток несколько писателей было. Я с дед-локами встречался, но они производили локальную остановку, но чтоб всю ОС, это как то импосибл.

Вот у меня иногда такие мессаги в любой проге вылетают в консоли IDEA:



не к добру это....

У насэто сообщение было связано с использованием нативного кода. Когда перешли с Java 1.4 на 1.6, где поменялся API JVM, то имели это сообщение.

Не хочется опять искать виноватых, но похоже проблема заключается в том, что после установки обновлений винды возникает такой эффект.

Стоит попробовать установить под тем же Linux для исключения момента влияния ОС.

Вот еще 1 пример полного зависания системы.
Шахматы
Вылечивается только кнопкой reset.