Изучаю java самостоятельно по книге Патрика Ноута. Книга довольно большая, более 1000 страниц. 
  Прошол первую часть где рассказано про основные понятия Java: типы данных, классы, аплеты и 
т.д. Во второй части описаны библиотеки. Но их очень много, не знаю на чем в первую очередь сосредоточить внимание. Изучать всё подряд, наверное мало эфективно, тем более начинающему.
 По этому просьба, может где  можно скачать конспект лекций, где отобрана и осмыслено на что в первую очередь необходимо обратить внимание.
 На сайте EPAM скачал План лекций и практических занятий. Но там только план, вот если бы скачать  конспект лекций по этому плану   было бы замечательно. Может кто занимался на тренингах по Java и остался конспект в эл. виде, вышлите, буду очень благодарен. 

Посмотрел оглавление - там почти все надо из первой половины книги. Не читай applets, оставь multithreading на потом. А в остальном пофигу по какой книге заниматься. После изучения основ будешь значительно лучше представлять чего тебе самому хочется делать. 
По моему так. 

Подозреваю, что лучший "конспект" это Java Tutorial. Он есть переведанный на www.javable.com

 По моему в книге только часть из найденного мною плана лекций, которые читают на курсах по подготовке Java, или может просто в книге оно по другому называется, вот план лекций, хотелось бы найти что нибудь похожее

 Курс    Тема    Лекции    Практика
Java Basics    1. Обзорная лекция по основам  ООП и языка Java 
- Язык Java
- Объектно-ориентированные возможности Java    4    4
    2. Основные конструкции языка Java
- компилирование и запуск Java-программ.
- типы данных
- cтруктуры данных (java.util.*)
- соглашения по наименованию
    4    4
    3. Объектно-ориентированные возможности Java.
Классы, пакеты, контроль доступа.
Вложенные, локальные, анонимные классы, классы-члены.    4    4
    4. Исключения в Java.
Try, catch, throw, finally.    1    2
    5. Threads, I/O, system resources
    4    4
    6. UML basics    2    2
    7. Log4j    1    1
    8. Приложение javadoc
Специальные комментарии. Создание документации.    1    1
    9. Jar-архивы
- Создание.
- Использование в приложениях и апплетах.    1    1
    10. Проектирование интерфейса пользователя.
Использование библиотек AWT и JFC Swing    4    4
    11. Applets
- создание апплетов. Их преимущества и ограничения.    4    4
    12. Java beans    1    1
Итого        31
32

JDBC
        1. Основы T-SQL    2    2
    2. JDBC Basics
Создание connection, получение данных через ResultSet, изменение данных, транзакции    4    4
    3. JDBC 3.0 API    2    2
Итого        8    8
Unit testing    1. jUnit – основы и особенности применения    2    2
            
Build tools    1. Ant – основы, примеры использования.    2    2
            
Системы контроля версий    1. Основы систем контроля версий. Обзор существующих систем. SVN.
- командная работа и правила общения    2    1
ORM Tools    1. ORM tools – обзор. Hibernate.    4    4
    2. Особенности применения Hibernate.
xDoclet, hbn2ddl    4    4
            
Internet технологии    1. XML/XSLT
- DTD, схема XML и обзор XSD 
- DOM и SAX parser
- обзор XSL/XSLT 
- обзор XPath    4    4
Java advanced    1. Интернационализация
- кодировка символов(Unicode, UTF-8)
- локали, .property-файлы  и ResourceBundle
- использование DateFormat, NumberFormat (DecimalFormat) и MessageFormat    2    2
    2. Распределенные вычисления с RMI
- Архитектура приложений с использованием RMI.
- RemoteObject, RemoteServer, UnicastRemoteObject.
- RMISecurityManager.    2    2
    3. Сервлеты и JSP
- Протокол HTTP. GET и POST-запросы. Коды состояния.
- Программирование сервлетов. Поддержка сессии.
- Использование cookies.
- Использование JSP
- Собственные теги.
- Bean-компоненты и JSP    4    8
    4. MVC
- обзор архитектуры MVC 
- Struts 
- управляющий сервлет
- объекты операций (forward и redirect)
- объекты форм (механизмы передачи данных)
- связывание событий (struts-config.xml)
- компоненты Struts View – собственные теги
- теги Bean 
- теги Html 
- логические теги    4    8
Итого        12    20
Обзор J2EE технологий    1. Application Server (Weblogic, jBoss, ...) –Обзорная лекция.
- сервера приложения и контейнеры сервлетов J2EE 
- обзор Jakarta Tomcat (конфигурирования, библиотеки, web-приложения, кэширования jsp) 
- среда разработки    4    4
    2. JMS    2    4
    3. EJB    4    8
    4. Web-services    2    4
    5. J2EE patterns    2    
    6. JAAS    2    
Итого        16    20
    10. Обзор PMC (документы, задания, учет времени)    1    
    11. Документирование и жизненный цикл проекта    1    
            
    Итоговый экзамен    4


Цифры, это количество лекций и практики соответственно.

IUser, этот список весьма широк. Для студента далеко не всё это обзаятельно.

У меня со студенческих времен есть конспект лекций, но он охватывает только первую часть твоего списка. 

К слову, мы тоже учились по книге Ноутона-Шилдта. Книга неплохая, но во многом носит справочный характер. Возьми книгу Эккеля, он интереснее и полезней.

 Брюс Эккель - Философия Java?

она родимая..   

 На сколько я могу предположить, после изучения первой части книги Ноута, лучше всего следует начать изучать Swing?

Не обязательно, смотря что ты будешь писать. Для разработки J2EE приложений Swing вообще не нужен.

 Да я и сам не знаю что буду писать, хочу выучить java и работать программистом, посаветуйте что на данный момент наиболее востребовано.

IUser
Вот же тема специальная.

J2EE. А вообще посмотри вакансии