Как сделать автообновление толстого клиента прозрачным для позльзователя?

С тонким клиентом понятно, просто заменить апплеты на сервере и броузеры клиентов увидят новые апплеты и будут работать с новыми апплетами.
А как сделать автообновление для толстого клиента, который в виде Java-приложения на строне пользователя? Ведь невозможно загрузить часть кода динамически во время выполнения приложения. 

Скачивать полностью новую версию и заставлять пользователя перезапустить приложение во время работы - хамство.
Заставлять пользователя пользоваться тонким клиентам - тоже хамство, не у всякого есть такой бандвит, чтобы юзать тонкий клиент.

Прошу вас, как опытных коллег, посоветовать пути создания автообновления толстого клиента.

Ну, во-первых, не обязательно качать всё. Достаточно корректно разбить приложение на модули и поместить каждый в свою жарку. А если вообще классами на винте рассыпать, то качать можно поклассово.  
Перезапуск не обязательно является хамством. Гляньте на того же Огнелиса. Скачиваешь новую версию расширения и он говорит, что для вступления в силу изменений надо перегрузиться. Можно это сделать когда угодно. Если изменения очень критичные (работать не будет), то перезагрузка обязательна. Главное - сделать перезагрузку достаточно удобной и не напрягающей пользователя.
Кстати, если я не путаю, то вэбстарт сам умеет обновлять изменившиеся либы при старте.

а Java Web Start?

http://java.sun.com/products/javawebstart/index.jsp

Причем, насколько я помню, WebStart даже поддерживает это самое обновление модулей.

Все просто, потому что путь один - как уже сказали, WebStart.