У меня вопрос по кукам: можно ли сохранять куки на на компьютере пользователя в той папке, куда ты укажешь, а не в стандартную temporary internet files?

99.9% что нельзя.

В формате HTTP-заголовка, отсылающего COOKIES, нет подобного параметра. И отдельного заголовка для таких целей тоже нет. 

Самое главное, не понимаю, зачем это Вам нужно. 

Если пользователь использует броузер, то он, если захочет, может удалить COOKIES из интерфейса самого броузера, не лазя ни в какие папки. Если же смысл в том, чтобы броузер не смог их найти и удалить таким образом, он не сможет их найти и для того, чтобы отослать Вашему скрипту. Тогда зачем было ставить COOKIES? Ведь броузер их не вернет.

Если же пользователь использует какой-нибудь другой клиент, над которым он имеет больший контроль (например, PHP-скрипт), он, скорее всего, проигнорирует Ваши пожелания о том, куда класть куки.