Аплет в NetBeans
(подписанный,умеет с файла читать)
В один из jFrame вставляю jFileChooser.
Когда запускаю Аплет в браузере получаю ошибку
java.lang.NoClassDefFoundError: Could not initialize class meWavePackages.Wave
    at sun.reflect.NativeConstructorAccessorImpl.newInstance0(Native Method)
    at sun.reflect.NativeConstructorAccessorImpl.newInstance(Unknown Source)
    at sun.reflect.DelegatingConstructorAccessorImpl.newInstance(Unknown Source)
    at java.lang.reflect.Constructor.newInstance(Unknown Source)
    at java.lang.Class.newInstance0(Unknown Source)
    at java.lang.Class.newInstance(Unknown Source)
    at sun.applet.AppletPanel.createApplet(Unknown Source)
    at sun.plugin.AppletViewer.createApplet(Unknown Source)
    at sun.applet.AppletPanel.runLoader(Unknown Source)
    at sun.applet.AppletPanel.run(Unknown Source)
    at java.lang.Thread.run(Unknown Source)

Без jFileChooser все работает,как это победить?

Не найден какой-то из твоих классов meWavePackages.Wave, дело не в JFileChooser.