Примерно такой вопрос уже обсуждался на этом форуме (http://forum.vingrad.ru/topic-154882.html),
но есть небольшая разница.
В моём случае мой javascript даже не появляется на .aspx страничке, хотя в .aspx-файл я его честно вставлял.
Возможно, разница в .NET (мой сайт на 1.х), и в том, что у меня MobileWebPage?

Как сделать, чтобы в десктоп-браузерной версии сгенерированной .aspx MobileWebPage присутствовал мой javascript?

Спасибо всем, разобрался.  
Для добавление скрипта в тело генерируемой странички ASP.NET предусмотрены методы  RegisterClientScriptBlock(),
RegisterClientScriptInclude(), и  RegisterStartupScript().
Проблема оказалась в том, что  MobileWebPage, к сожалению, эти методы не поддерживает :[