Задача такая. Есть почтовый сервер, писма он хранит в базе данных MySQL (dbMail), тело письма хранится в BLOB поле и в зависимости от кодировки и MIME TYPE раскодируется по-разному. Это все описано, похоже, в спецификации почтового стандарта (http://web.opennet.ru/docs/RUS/mime_rfc/index.html). Нужно сделать веб клиента, который бы показывал отправителя, получателя и тело письма (предположим без приложенных файлов, хотя если есть предложения по ним, тож интересно). 
С какой стороны вообще подойти к задаче? 
Есть ли готовые решения для парсинга тела сообщения?

Парсить тело сообщения - ну вообщем зависит от MIME TYPE - наверняка можно поискать в Инете.

По поводу вообще задачи - ставиться тот же Tomcat, пишется сервлеты и JSP для отображения. Наверно надо сделать какой-то экран для запроса пароля и логина. Хорошо бы поначалу расписать, что конкретно видит пользователь и какие действия он может предпринять. Посмотреть какие экраны надо - ну и вперед. Если ты вообще нчиего не понимаешь - то можно посмотреть пример простого приложения - Студенческий отдел кадров

Там с 7 части расказывается как строить WEB-приложение. Может и не совсем красиво, но доступно.

Да не... с технологией WEB-то я работал. Меня больше интересует парсинг. Если есть спецификация, то 100% есть реализация. Вот только не видел для java. Все e-mail клиенты должны это дело реализовывать.