Подскажите пожалуйста как откомпилировать С++ код (несколько файлов) просто в один кусок бинарного кода по x86 процессоры без указания операционной системы на которой код будет работать.

Почитай хелп по Intel C++ Compiler

Откомпилировать с указанием ОС, потом из исполняемого файла вырезать нужный бинарный образ. Под Linux (и не только) это делается связкой gcc + objcopy

А можно чуть подробнее, я в опциях компилятора ничего подобного не нашел.



А как совместить это с рантайм библиотекой с++, там сплошь обращения к ОС.
Я правда думал, что вопрос решиться переопределением собственной версии оператора new, но не уверен что-то.

Никак   
Угу
libc тоже нужна своя, так что одним new это не ограничится.
Библиотеки должны быть полностью свои, или сделанные специально под embedded систему (типа uLibc)

Ну прям беда, мне из рантайм библиотекой собственно ничего и не надо, только чтобы классы создавались и уничтожались .
Я наивно полагал, что new естественно пользует api ОС для выделения/освобождения памяти, а остальная функциональность типа поддержки виртуальных методов и т.д. от ОС ничего не требует. Мне важно только с++ код компилировать, а все остальное типа ввода-вывода и т.д. - это мой код мог бы делать.

Пока видимо светит все тот же чистый Си. Печально.  

Для С++ рантайм в основном нужен для исключений и rtti. new & delete можно переопределить прямо из программы, для этого даже не нужна библиотека. Некоторые компиляторы могут использовать библиотеку для своих внутренних нужд (типа копирования структур, реализации new[] и пр, но таких все меньше и меньше). 
У вменяемых компиляторов (например у gcc) весь плюсовый рантайм (в урезанном виде) можно собрать самому.
Отнюдь. Ведь пишут embedded приложения на С++, можно посмотреть на eCos к примеру

sopot, интересно, зачем нужна программа, которая умеет только создавать и удалять классы? А о выводе информации ты не забыл? Ведь именно все операции с вводом и выводом лежат на плечах ОС. А без них, твоя программа лишь способствует глобальному потеплению, так как никакой пользы от ее работы получить никому не получится.
Именно поэтому не сущетсвует бинарников, которые работают одновременно под всеми ОС (java и т.п. не в счет).

Автор обещал об этом позаботится лично   
В порядке телепатии - у автора embedded приложение, т.е. ОСа там как такового нет.

А... Ну тогда другое дело...

Ну конечно не все так плохо, чтобы просто классы создавать/удалять.   
Библиотека вывода написана давно, ничего сложного нет ни в граф ядре используемого процессора, ни в коде. 
Просто требуется значительно расширить проект, отсюда и желание с++.

sopot, какой компилятор?

IAR Embedded Workbench. Проект под Cirrus Logic EP9315.
Проект расширяется и переходит на AMD Geode LX 800.
IAR под х86 не компилирует, а примерный размер проекта в новом варианте с Си не дружит.

Тогда бери gcc. Toolchain можно выдрать из eCos