привет всем. 
в общих чертах нужно сделать следующее - Java приложение, которое запущено постоянно (наверное как сервис Windows). Оно периодически (период берется из настроечного файла) проверяет некоторые таблицы. В случае появления новых данных, делает определенные действия. 

нужны советы, как лучше:
1) решил делать как сервис, для создания сервиса буду использовать Java Service Wrapper, есть ли варианты лучше?
2) посоветуйте как лучше реализовать периодичную проверку?

Насколько я знаю это сделать нельзя напрямую через java.
Можешь посмотреть вот это Java service wrapper

Для переодических действий есть фреймворк Quartz.

А вот с сервисом не совсем понятно - может исключительно виндовый сервис не нужен.
Можно ,к примеру, поместить в автозагрузку винды bat скрипт с запуском того же Quartz и обойтись без виндового сервиса, а необходимые действия реализовать как обычный класс.
Или пойти более сложным путем - немного ознакомиться с OSGi , установить Equinox , установить в него OSGi реализацию Quartz, и реализовать свои действия в виде OSGi сервиса.А потом ,снова-таки, через автозагрузку винды стартовать Equinox а он уже стартанет и кварц и твой сервис.
Или же вместо сервиса использовать встроеный веб сервер - Jetty или Tomcat и ,снова таки, автостартовать его.

Хотелось именно как сервис Windows, и я уже сделал это с помощью Java Service Wrapper (удобная штука, кстати). Теперь вопрос как лучше организовать периодичную проверку. Пока почитаю про фреймворк Quartz, спасибо за инфу

Можно попробовать сделать на примере Tomcat, он на Java написан и стартует как сервис в винде. можно поковыряться в исходниках, посмотреть как в нём сделано.

Вообщем сделал с помощью Java Service Wrapper и Quartz, получилось хорошо. Всем спасибо.