Я сам не админ, но мнения знакомых админов расходятся.
Так что же всё-таки выбрать и почему?

А чем обусловлена такая постановка вопроса? В чем проблема взять любую ось наугад? И начать уже дело делать, а не сидеть над бессмысленными вопросами.
Допустим, выбрана CentOS, по алфавиту она первее. Что может плохого произойти в этом случае? Сервер упадет? Вряд ли - мильён веб-серверов под этой осью работают и даже не взрываются. 
Или наоборот - выбрали FreeBSD. CentOS оказывается на свалке истории. Это послужит причиной краха проекта? Вряд ли. С гораздо большей вероятностью причиной краха послужат неумелые действия админа. 

Отсюда делается логичный вывод. Гораздо важнее выбрать не операционную систему, а оператора.

Допустим, я хочу научиться администрировать сервера.
У меня есть свой сервер с серьёзной нагрузкой и появятся ещё.
На моём сервере стоит CentOS и за него отвечает мой админ.

Но что выбрать мне? Для других серверов и для обучения.

Странно. Научиться хочет администрить CentOS, а поставить хочет FreeBSD.
Раздвоение личности - не иначе.

Да я просто не знаю что лучше...

Вот именно про это цитата выше.

Надеюсь, что они действительно не сильно разнятся.
Сносите топик.
Спасибо.

То, для чего проще найти "гуру", склонного отвечать на вопросы (или справочную информацию вообще). Грубо говоря, опрашиваем всех "знакомых админов", согласны ли они помочь в случае необходимости, потом выбираем ту систему, для которой ответивших "да" больше.

 Если и в этом отношении все одинаково - выбирать CentOS. Из тех же соображений - информацию по Linux в среднем найти проще, чем по *BSD.

 Ну тогда и разницы нету. Честное слово.