Добрый день.
Имеется скрипт . повешенный на Cron, который проходит по довольно объемной базе данных ежедневно и обновляет некоторую информацию.
Если упростить модель, то структура БД: 3 таблицы, и получается 3 вложенных цикла

оптимальнее всего делать одним запросом

sandland, 
1. Проверяем флаг, говорящий, что запрос выполняется. Нужно, чтобы не запустить одновременно несколько одинаковых кронов.

2. Формируем запрос вида:


Где X — запоминаемая после каждой отработки переменная, C — количество обрабатываемых за один раз строк.

3. Обрабатываем, запоминаем и наращиваем X: X=X+100;
4. Повторяем 1. пока запрос не вернёт пустой результат.

LIMIT X, C

Опс, пардон, модераторы, перенесите в PHP и базы данных )