Здравствуйте! Я совсем новичок, поэтому не пинайте меня сильно, если вдруг мой вопрос покажется Вам глупым. 
Дано: Visual Studio 2007, MFC.
Итак, мне необходимо написать программу, где пользователь мог бы собирать схемы из элементов (аналог Simulink) и строить переходные процессы, логарифмические характеристики, амплитудо-фазовые характеристики полученной системы.
Программу я собираюсь писать самостоятельно, но все же хотелось бы посоветоваться, может, есть какие-то классы или алгоритмы, с помощью которых удобнее было бы написать прорисовку сбора схемы и построение графиков функций. Может, есть какая-нибудь хорошая статья или совет на эту тему. Хотелось бы знать с чего начинать разбираться, в общем. Заранее спасибо.

Даже не знаю, что и сказать... Вопрос звучит примерно так: собираюсь построить виллу в стиле позднего ар-деко. Скажите, какие бывают кирпичи и где их берут?

Первый вопрос - зачем? Если это какая-то реальная задача - возьмите уже готовые инструменты, благо их немало.

Если это что-то учебное - язык и библиотека классов жестко заданы или их все-таки можно поменять?

P.S. Earnest совершенно прав, только я бы добавил к вилле и кирпичам еще одну деталь: "Дано: есть бульдозер".   

Фантом, тогда уж не бульдозер, а два таджика с лопатами.  

Newbie2010, сначала программу такого уровня нужно спроектировать - спецификации, архитектура, пользовательский интерфейс и прочая фигня.
Впрочем, призывать человека проектировать свою первую программу бессмысленно. Никто никогда это не делал, наверное, в том числе я. Хочется сразу что-то написать. Начни с пользовательского интерфейса, например: наверняка в уме есть представление, как это должон примерно выглядеть. Вот и вперед. 
А как рисовать графики - это 25 проблема. Скажу лишь, что писать нужно так, чтобы менять отдельные реализации можно было по 5 раз на дню, не трогая остальное приложение. Это трудно сразу, но хотя бы попытайся.