Нужно сделать обработку нажатия клавиш, но её нажатие посылается фокусированному контролу. Как сделать, чтобы независимо от выделенного контрола, обрабатывалось событие?

Стандартное место для этого - PreTranslateMessage родительского окна. Лови WM_KEYDOWN, проверяй фокус (или не проверяй, если всегда-всегда, но тогда редакторы работать не будут) и вперед. Логично связать команды с клавишами в таблицу акселераторов, тогда нужно будет просто вызвать TranslateAccelerator(). Но можно и руками проверять что за клавиша и какую команду выполнить.