Допустим у нас весь контент сайта обновляется все файлы с веб конфигом, и в этот момент кто то попытается получить доступ к одной из странице,  надо как то показать страницу ошибки или какая то страница с нотификацией что сайт на данный момент обновляется, как это можно реализовать в IIS-е? 
я вот подумал добавить какой нибудь Custom Error Code и страницу для него, потом на уровне аппликейшна если возможно в IIS-е обявить переменное и если это переменное ровно true то всегда при запросе отоброжать эту страницу:
такое вомзможно реализовать? или есть какой нибудь способ попроще?

Посмотрите страницу http://support.microsoft.com/kb/224070