Есть два винчестера, на втором только фильмы, т.е. он используется в основном, только при просмотре фильмов и кодировании. Как программно выключать этот винт, точнее как сделать так чтоб он отключался при некотором простое?

Можно попробовать попробовать убивать его контроллер... Поможет только до перезагрузки...

Панель управления\Электропитание
Под XP вроде работает, но есть одно но. Когда открываешь папку Мой компьютер, он начинает проверять содержимое всех дисков и в том числе этого и соответственно он включается. Так что реальной пользы от этого мало, если только попробовать его смонтировать как папку NTFS.