У меня на главном окне программы есть задний фон, он является картинкой.

Этот фон может менять пользователь (из выбранных на сервере).

где хранить бэкграунд что бы нормально все происходило, просто я до этого хранил в самом проекте, а я так понимаю нужно хранить просто в папочке image (к примеру)

А нельзя ли организовать хранение на сервере? Представь, сменил винду пользователь. Запустил свою любимую прогу. А все настройки на месте 
А если в будующем тебя на сервелат потянет? то задумайся сейчас об этом. Сервелат тебе не позволит сохраняться на компе пользователя.

ну как бы и грузить большую картинку тоже не хочется..

+ я настройки хранятся на сервере, если не будет найден файл то загрузится ... я уже вроде решил этот вопрос просто храню рядом проектом.