Как сделать так, что бы слой выравнивался по нижей границе браузера? Т.е. я двигаю размеры окна, а слой всегда занимает нижнюю границу.

Проще сделать фреймом, мне кажется. Если не подходит, я бы предложил так:

Есть свойство в стилях position: fixed; - это зафиксирует слой относительно окна браузера и не даст прокручиваться. Остаётся выяснить высоту окна, отнять от неё высоту твоего слоя и обновлять эти параметры на событии window.onResize() . Как узнать характеристики элемента - читай тут: http://forum.vingrad.ru/index.php?showtopic=31375 (там про ширину, для высоты замени 'Width' на 'Height').

Такие дела...