Создаю свой контрол, и когда добавляю его на форму, то форма перестает рисоватся в дизайнере, пишет "Problem loading"
И в окне ошибок появляется такая ошибка "Could not create an instance of type 'MyControl'"
Но когда запускаю проект, то все отлично работает, и контрол нормално отображается. 
Не подскажите в чем может быть проблема?

В дизайн-тайме нужно уметь поддерживать работоспособность компонента. То есть нужно учитывать несколько нюансов. Например, Application.Current равен null, вызовы к сервисам не выполняются и множество других вещей. В дизайн-тайме в вашем случае сейчас происходит какая-то ошибка (во многих случаях сам дизайнер студии выдает стек-трейс до места обрыва, но иногда нет). Внимательно проследите за вашим кодом. Также, в инете где-то была статья (помоему даже на МСДН), описывающая нюансы дизайн-тайма.

Если это возможно можете дать ссылку на статью? А то никак не могу найти...

Конкретно ту статью не помню, где я нашел ее. Набери в гугле "wpf design time", думаю много почерпнуть можно.