Добрый день всем! Так как я относительный новичек в Джаве то столкнулся с проблемой, уже голову сломал как решить тривиальную но как оказалось мне не по силам задачу.

Проблема: не могу откомпилить и запустить одно приложение!!!!

Описание: приложение называеться CASTOR оно построенно на двух других приложениях ProtoPeer и JiST/SWANS, это симулятор сетей.
Для начала работы с ним мне надо откомпилить и запустить его, использую Linux Ubuntu 12

Ниже ссылка на само приложение.
В архиве:
- сама прога и исходниники
- библиотеки
- текстовые файли с сылками на ресурсы с инфой по программам 

http://dl.dropbox.com/u/25369700/castor_simulator.zip

Если будут проблемы со скачиванием или еще какие-то вопроссы то отвечу на все, пишите на почту [email protected]

Опишите пожалуйста, что уже пробовали делать сами, какие ошибки наблюдаются, какая версия JDK у Вас стоит и под какую написан этот софт.

стоит 1,6....точно знаю что на 1.6 работает
Необходимые библиотеки запихнул в каталог джавы с библиотеками

просто до сегодняшнего момента я работал с джавой приимущественно в Эклипсе, а там с компилирыванием и подключение библиотек как бы проблем нет совсем))))  а через командную строку компил програмки в один файл, а тут не понимаю как откомпилить все сразу.

Тогда Вам сюда

Там рассказано как подключить библиотеки из консоли и скомпилировать дерево исходников

Это я читал, и знаю, хотя о Classpath было повторить не вредно =)
Но проблемма осталась, так как само приложение состот с разных пакетов
Вот так:
scr:
  |- jist
  |     |- minisim
  |     |- runtime
  |     |- swans
  |
  |- protopeer
        

В папке jist три папки без исходников, Маин лежит в папке рантайм
Все файли в папке jist принадежат пакету jist, но в папке protopeer принадлежат пакету protopeer

Запустил на компиляцию, вложил ДЖАРЫ в паку classes но получил кучу ошибок, вот часть их: