Подключаюсь к серверу через RAdmin для передачи файлов с сервера на свой компьютер ('File transfer'), но на двух дисках сервера ничего не видно... C двумя другими все нормально.
В режиме 'Full control' все нормально.
Скажите, если кто знает, из-за чего такое может быть?

Я тут.

Скорее всего на том компе паралельно в резидентном режиме работает ещё одна программа каторая перехватывает функци апи, адресованные на те два диска.
Функции типа FindNext FindFirs.

PS: Пример такой программы я выложил в разделе делфи.