Добрый день. 
Время от времени пишу программы в процедурном стиле.
при этом проверка работоспособности и вообще доводка процедур и функций производится на отдельных стендах (отдельная программа с окнами ввода-вывода и кнопками управления)
при таком подходе на ЖД образуется большое количество каталогов с разными версиями подпрограмм(по мере их доработки) плюс справочные материалы по теме, в общем материалы проекта даже по небольшой программе раздуваются до нескольких гигабайт.
Для ведения проекта необходима программа со следующими возможностями:
1. два поля, левое и правое
- в левом поле что то вроде проводника, каталоги и файлы проекта, причем так что бы можно было запустить файл проекта ДЕЛФИ из этого проводника
- в правом поле возможность писать комментарий (что за каталог или файл, для чего предназначен и прочее)
2. в проводнике возможность создавать каталоги в том числе корневой в любом месте на ЖД

Вопрос: есть ли такая программа? и если есть, как называется

Может проще глянуть в сторону систем контроля версий? По-моему в комплекте с Delphi даже есть какая-то. Ну или что-то стороннее. Это решит проблему с "раздуванием" проекта на корню. И комментарии там можно к каждому изменению писать. И откатить. И еще много всего.

Одноначно система контроля версий. Можете попробовать SVN - простая и доступная. Есть Visual SVN Server в качестве сервера. В делфи есть в последних версиях SVN клиент. Стандартный показался недостаточно функциональным и я пользовался сторонним плагином (какой-то VerInsPlusBeta10). 

Незачем выдумывать "свой путь", лучше довериться решениям, с которыми работают миллионы.

Тут я пому поработать КЭПом и посоветовать называть файлы модулей uModuleForDoingSmth.pas и так далее