Здравствуйте!
Возникла следующая проблема:
Решила переустановить xampp. Удалила установленный xampp(через панель управления), установила новый xampp, при этом указала папку отличную от папки старого xampp. 
Потом обнаружила, что в старой папке xampp осталась только папка htdocs! Куда пропали файлы баз данных и всё остальное? Неужели они удалились?!

Поиск по именам файлов по всему диску ничего не даёт? В корзине - пусто?
Восстанавливай последний бэкап.

Всё пусто. Но как так произошло?

Если устраивать соревнование между возможными причинами - я бы поставил на кривую сборку, на не кривой компонент. Но вообще это гадание на коофейной гуще.

Одни всегда делают бэкапы, другие будут так делать...

Кстати, БД вряд ли кладётся в папку XAMPP - чисто теоретически (если не начудили сборщики) она должна находиться в папке общих компонентов MySQL-сервера...

xampp всё складывает к себе в каталог.