Хочу сделать , чтобы перед выполнением программы все окна сворачивались (это работает) а после выполнения опять восстанавливали  своё положение...

Наподобие стандартного Виндового значка "Свернуть все окна" , нажатие повторно которого ВОССТАНАВЛИВАЕТ положения окон до сворачивания ...
Красиво сделано - окна , которые были открыты, максимизируются ,
а окна, которые были свёрнуты так и остаются ...


Внизу код сворачив. окон, а как сделать обратное восстановление положений?

bool __stdcall EnumProc(HWND hWnd, long)
{
char bufer[100];
if(hWnd == NULL)
return false;
GetWindowText(hWnd, bufer, sizeof(bufer));
if(bufer[0] && IsWindowVisible(hWnd) && !GetWindowLong(hWnd, GWL_HWNDPARENT) && strcmp(bufer, Application->Title.c_str()))
SendMessage(hWnd, WM_SYSCOMMAND, SC_MINIMIZE, 0);
return true;

EnumWindows((WNDENUMPROC)EnumProc, 0);
}

во-первых вместа SendMessage(... SC_MINIMIZE ...)
можно выхвать ShowWindow(hwnd, SW_MINIMIZE) :

а чтобы востановить ShowWindow(hwnd, SW_RESTORE);

я предполагаю, что "RESTORE" окнам надо делать в обратном порядке
(чтобы востановить Z порядок)

P.S. проверять "Свой не свой" по имени я бы не советовал!!!