Приведу пример. В питерском политехе готовят по специальностям:
прикладная математика и информатика; математическое обеспечение и администратирование информационных систем; вычислительные машины, комплексы, системы и сети; автоматизированные системы обработки информации и управления; системы автоматизированного проектирования; ПО вычислительной техники и автоматизированных систем; информационные системы и технологии.

Мягко говоря, я путаюсь в этом ряду. Объясните, пожалуйста, в чём основные отличия. Где больше занимаются "железом", где программированием, где готовят сисадминов и т.д. ?

Легче спросить у заведующих кафедрами и т.п. )). На сайте моего универа есть список предметов на каждом курсе для всех факультетов и специальностей.