Although a derived class can access protected members of its base class, it cannot do so through an instance of the base class. 



С чем связано такое ограничение?

QryStaL, 
с тем, что в данном случае B выступает в роли клиента класса A, а protected поля не доступны клиентам.

всё дело в семантике использования класса A

Не совсем понятна эта фраза. Если я напишу след. код:



то все нормально скомпилится.

QryStaL, а почему этот код не должен скомпилиться? Класс C знает о своём внутреннем устройстве посему и внутри себя он как хочет может манипулировать объектами этого класса

Partizan, правильно, по той же логике в первом примере класс B унаследован от класса A и поэтому имеет доступ к его protected членам.

QryStaL, в одном случае класс является клиентом сам себя, а во втором один класс является клиентом второго класса

 protected void Do() использование ограничено классом, в котором он определен

из MSDN:

Error Message
Cannot access protected member 'member' via a qualifier of type 'type1'; the qualifier must be of type 'type2' (or derived from it)


Although a derived class can access protected members of its base class, it cannot do so through an instance of the base class.

The following sample generates CS1540: