Я создаю пустой dll проект, в котором описываю два класса и функции к ним.
Затем - 

При компиляции требует - boost_python-vc90-mt-gd-1_38.lib и python25.lib, и я ему это даю.
И всё замечательно компилиться в module_py_dll.pyd.
В питоне при попытке импортировать module_py_dll.pyd, приложение начинает требовать python26.dll (хотя у меня стоит python 2.5.4).

Подскажите в чём может быть причина!
Boost устанавливал при помощи BoostPro, который коннектится куда нужно и устанавливает нужные бинарники.

P.S.
При попытке подсунуть питоновскому приложению python26.dll или python25.dll вылетает с ошибкой - Fatal Python error: Interpreter not initialized (version mismatch?)

видимо он установил не те бинарники)
попробуйте самостоятельно собрать boost, с нужной версией python, либо установите python 2.6  

А boost имеет какие-то поддерживаемые версиипитона?
У меня boost 1.38 - может он поддерживает толбко питон 2.6 и выше?
Есть где-нибудь такая информация? Я не смог найти.

поддерживаются все версии, начиная с 2.2, в документации об этом и о том, как собрать boost.python для определенной версии python подробно написано:
http://www.boost.org/doc/libs/1_38_0/libs/...c/building.html

Добавлено через 3 минуты и 34 секунды
у меня установлен python 2.5, сборка boost-python лишних телодвижения не потребовала, запустил bjam, обнаружил в папке lib библиотеки boost_python-vs80***

Но в чём причина того, что при компиляции требуется python25.lib, а при использовании - python26.dll?

Спасибо за советы.
Проблема решена установкой boost 1.35 - самая старая версия с поддержкой vc++9.0
Всё замечательно работает и не требует питоновских dll.
Скорее всего boost 1.38 питает большую любвь к питону 2.6(по умолчанию) если устанавливать его  со скомпиленными бинарниками.