На сервере установлена FREE BSD, Nginx, apache 2.
Размер оперативной памяти 1ГБ, максимальный размер swap файла 2ГБ
Происходит следующее: при переполнении файлы вешается сервер, пропадает доступ к серверу по SSH и требуется перезагружать сервер.
Есть ли возможность избежать данной проблемы путем периодической очистки памяти или другим способом?

После прочтения заголовка так и тянет спросить - "плохо зависает"? 

Чем же вы так переполняете свою файлу?

>Чем же вы так переполняете свою файлу?

Сайт написан на PERL. Я так понимаю происходит следующее: При определенной нагрузке на сервер в памяти растет кол-во дочерних процессов апача HTTPD или объем занимаемых ими памяти. Служба поддержки отписывается, что как только переполняется свап файл то вешается nginx. Но опять таки точно причину я не могу сказать. По идеи надо смотреть логи, но проблема в том что я в этом мало что понимаю. 

У вас везде, где надо, останавливаются скрипты? командой break, например?

>У вас везде, где надо, останавливаются скрипты? командой break, например? 
А разве в PERL есть break ?

Не совсем понял вопрос. По идеи после завершения работы скрипт начинает работать сборщик мусора.  

Не знаю как, но был случай в практике - не закрытая операция в джава-скрипте просто-напросто запускала цикл, который "слегка вешал" сервер. Благо вовремя просекли причину и починили этот скрипт.

>Не знаю как, но был случай в практике - не закрытая операция в джава-скрипте просто-напросто запускала цикл, который "слегка вешал" сервер. Благо вовремя просекли причину и починили этот скрипт. 

Да, вполне может быть, но вопрос в том как это просечь? Как узнать какой именно скрипт вешает сервер или порождает утечку памяти. Может быть как-то через логи?