При сохранении страницы полностью на своём Компе также сохраняются и все вложенные JavaScript`ы.

Реально ли сделать так, чтобы определённые JavaScript`ы оставались на сервере, а не копировались User`у?

не знаю, в msie вроде js файлы не сохраняются на диск
(только в темпорари файлы)

Выбираешь <Файл><Сохранить как...><Тип файла - Веб станица, полность..>

и сохраняется файл ИМЯ.html и директорию ИМЯ.files

А вот там-то и сохраняется всё подряд (gif, jpg, js ....)

Я где-то встречал, что при сохранении сохраняется всё кроме js (хотя может это просто ошибка)

А зачем? Боишься, что скрипт скачают? При желании даже если найдешь нужное решение, можно просто открыть сорс страницы и wget http://скрипт такой-то. Так что товарищ, несбыточна мечта.

предположение почему js не сохраняют
ведь расширение js интепретируется wscript.exe вроде, не все ведь его на текстовый редактор ассоциируют

Странно. Вроде всегда считалось что если скрипты вызываются по протоколу http, то обрабатываются они только броузером и ничем больше. Если они у кого-то не сохраняются, то просто этот кто-то слишком завышает настройки безопасности в броузере, что он все скрипты отсекает

попробуй на *.js щелкни на новой винде