Суть в следующем: есть электронный учебник (набор html-страниц в одном каталоге), в нем же находится exe-файл, который позволяет редактировать html-страницы.
Задача: нужно, чтобы на главной страницы электронного учебника распологалась кнопка запуска этого exe-файла (exe-файл находится в том же каталоге что и html-страницы).

Я, мягко говоря, несилен в web-программировании и мне очень нужно разрешить данную проблему.

Как в данном случае запустить exe-файл?

Так обычно не делают. Надо править файлы - пиши на ПХП скрипт, а не екзешник. Править файлы на серваке ЕХЕ не сможет, ибо запустится на клиенте.
Насчет запуска ЕХЕ со страницы: делай простую ссылку на файл, браузер предложит пользователю скачать или скачать и запустить его.