Пытаюсь в программе на Борланде отловить событие изменения разрешения экрана.

Для этого пишу :

...
Application->OnSettingChange=OnSettingChangeEvent;
...

void __fastcall TPreferences::OnSettingChangeEvent(TObject *Sender, int Flag, const AnsiString Section, int &Result) {
    if(Flag==SPI_SETWORKAREA) {
        ...
    }
}

Почему-то при изменение разрешения программа входит в эту процедуру с Flag=0, Section = "Windows".

Это нормальное поведение процедуры или ошибка?

Отлавливайте сообщение WM_DISPLAYCHANGE.