Конечно же лучше когда все отдельно. Стили в CSS, а страничка сама по себе.
Предположим к десяти страницам будет подключен CSS.
Простой пример!
В случае когда стили в css. что бы поменять все 10 страниц достаточно изменить только CSS!  а если все будет в html то придется менять все 10 страниц! Конечно есть разница. Экономишь много времени! 

Зачем чтота доводить, просто  сверстай сай в обих  вариантах а потом  посмотри размер страницы и когда сайт уже будет интегрирован в програмную чась попробуй там чтота изменять. Думаю тогда вопрос сам собой отпадет.